主人公御影迅是从江户时代开始就肩负国防任务忍者的子孙，
在这样世家中成长的迅还在以忍者为目标修行，目标是秘密谍报员母亲的继承人。
为了解决引起社会骚动的“蝙蝠事件”，他奉命转入冬華学園。
同搭档AIモモカ一起潜入学园后的讯，与
同学カノン・メイフィールド、
骑士白鐘神楽、
骑士团长蓮城寺舞、
以及后辈雨ノ森ゆい等人加深了关系，在不被怀疑的情况下进行着任务.。
但是，由于某个意外事件，カノン发现了迅的真实身份。
对讯来说身份暴露就意味着任务的失败，但カノン没有把迅的真实身份告诉任何人，作为条件却要求到：
“请让我成为忍者！！”
迅究竟能不能顺利完成任务呢？
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